В начале Великой Отечественной войны повторно был призван в армию. Окончил пехотное училище, затем курсы «Выстрел». С сентября 1942 года — на фронтах Великой Отечественной войны. Участвовал в Сталинградской битве, был ранен. С августа 1943 года гвардии капитан Василий Жуков командовал батальоном 204-го гвардейского стрелкового полка 69-й гвардейской стрелковой дивизии, 4-й гвардейской армии Степного фронта. Отличился во время битвы за Днепр. 5-6 октября 1943 года батальон Жукова успешно переправился через Днепр в районе села Старолипово Светловодского района Кировоградской области Украинской ССР и захватил плацдарм на его западном берегу. В боях за удержание плацдарма Жуков неоднократно поднимал своих бойцов в контратаки. В боях батальон уничтожил 10 танков и около полутора батальонов пехоты противника. Указом Президиума Верховного Совета СССР от 22 февраля 1944 года за «образцовое выполнение заданий командования и проявленные мужество и героизм в боях с немецкими захватчиками» гвардии капитан Василий Жуков был удостоен высокого звания Героя Советского Союза с вручением ордена Ленина и медали «Золотая Звезда» за номером 3575